La Biblioteca Nacional de Antropología e Historia custodia, en su área de manuscritos, la Colección de Diarios de José Fernando Ramírez, cuarenta y dos cuadernos en los que el historiador copió o hizo copiar documentos importantes para la historia del país albergados en bibliotecas, archivos y colecciones nacionales, europeas y particulares. De las primeras cabe destacar los informes secretos sobre la guerra de Texas, los diferentes inventarios de la colección de documentos de Lorenzo Boturini, 10sAnales de México y sus Contornos; de las copias realizadas en Europa, son de especial interés las provenientes de la colección de don Juan Bautista Muñoz, las de la colección de don Manuel Gallangos, las de los documentos pertenecientes a la Academia de Historia de Madrid y los de la Biblioteca Imperial de París.