El Colegio de Santo Tomás al tiempo de la expulsión de los jesuitas Cuadernos de Estudios Jaliscienses
La expulsión de los jesuitas del territorio español y de sus posesiones de ultramar es un hecho histórico muy controvertido. A la fecha no está del todo claro el motivo que obligó a Carlos m a firmar el Real Decreto, mediante el cual declaró a los integrantes de la Compañía de Jesús personas no gratas en sus vastos dominios.Las causas de la expulsión en España pueden remontarse al conflicto originado en el siglo XVII, la controversia entre la Orden de Loyola y los jansenistas. Estos últimos habían atacado las doctrinas del jesuita español Luis Molina sobre la gracia y el libre albedrío, además criticaban a los jesuitas por luchar contra la tendencia de limitar la autoridad papal. Por otra parte, los obispos de Francia proclamaron los principios galicanos, según éstos el poder temporal era independiente del espiritual; consideraban al Papa como presidente honorario de la Iglesia cuyo poder debían restringir los soberanos. Las agresiones en contra de los jesuitas se iniciaron en la Península Ibérica cuando, en enero de 1759, se decretó la supresión de la Compañía en Portugal y en sus posesiones imperiales.